Esto es posible gracias a SpeeDefrag, programa gratuito y del cual ya había hablado antes, pero que ahora se encuentra disponible para su descarga en su nueva versión 5.0.2.

SpeeDefrag desfragmenta particiones o el disco duro en su totalidad con los ajustes optimizados de Windows, lo que hace que la tarea sea más eficiente y rápida. Además, también permite programar la desfragmentación a una hora determinada y lo más interesante es que incluye una opción para apagar la computadora cuando la desfragmentación concluye.
Esto es muy útil, por ejemplo, para dejar nuestro disco duro desfragmentándose durante la noche y luego de finalizada la tarea la PC se apague automáticamente.
Atención: la aplicación también solicita la instalación de otros programas considerados como Adware (publicidad no deseada), esta instalación es opcional y se puede rechazar, así que presta atención mientras sigues el asistente de instalación.


Sitio web y descarga: SpeeDefrag (1,31 MB)
Compatible con Windows XP y Vista
Actualización: desfragmentar disco en Windows 7.
Véase también:
¿Qué significa desfragmentar el disco duro y para qué sirve?

Anónimo
Hace un tiempo había "creado" un .bat para dejar desfragmentando la partición C y que se apague al finalizar
start /wait defrag c: /f
shutdown /s
sencillo no?
Maxi R.D.